Kulcskülönbség : koaguláció azt jelenti, hogy tönkremegy; alapvetően olyan kémiai folyamatra utal, amelyben a nem rendezhető részecskék destabilizálása történik. Ezek a részecskék koagulálószer segítségével képződnek. Másrészről a flokkuláció azt jelenti, hogy flokkok képződnek. Olyan fizikai vagy mechanikus eljárásként írható le, amelyben a koagulált csomók vagy pelyhek össze vannak kötve, hogy tömegeket képezzenek felhőként, majd csapadékként.
A víz kolloid szilárd anyagokat tartalmazhat, mint pl. A nem lebegő szerves anyag, agyagrészecskék, baktériumok, plankton, károsodott növényi anyag kis részecskéi stb. Így ezek a szennyeződések vízzel való elválasztására alkalmazhatók.
A koagulációt a részecskék semlegesítésével érjük el, és így a részecskék közötti visszahúzódó erő jelentősen csökken. A flokkulációs eljárás alkalmazása után a koagulált részecskék nagy agglomerációt képeznek, amely szintén floc néven ismert.
A flokkuláció során ezek a destabilizált részecskék agglomerációi nagy részecskék formájában alakulnak ki. Ezt úgy érhetjük el, hogy nagy molekulatömegű, vízben oldódó szerves polimereket adunk hozzá. Ezeknek a polimereknek köszönhetően a floc mérete nő, majd a részecskék leereszkednek. Nagyon fontos, hogy a flokkulálószert óvatosan lassú sebességgel keverjük össze, hogy a kis flokkok könnyen részecskékké váljanak, és végül leülepedjenek.
A vízkezeléshez a koagulációt általában flokkuláció követi.
Így a vízkezelés szempontjából mindkettő könnyen megkülönböztethető. A koaguláció során koagulálószert adunk a részecskék összegyűjtéséhez. Másrészt a flokkuláció során az oldatot óvatosan összekeverjük, hogy a koaguláció során keletkező kis csomók összegyűljenek és nagyobb csomókat képezzenek. Ezek a nagy csomók könnyen leülepednek, és így elválaszthatók.