A legfontosabb különbség: az MOV és az AVI két különböző típusú konténerfájl. Ahogy a név is sugallja, a konténerfájlok olyan fájlok, amelyek általában valamilyen videót és / vagy hangot tartalmaznak. A legtöbb ember nem veszi észre, hogy az AVI és a MOV nem kódolási formátumok, hanem a formázott videofájlok csomagolói. Lényegében a kettő között a fő különbség az, hogy egy MOV fájlt először csak az Apple számítógépek használtak, míg az AVI-t a Windows használta. Lényegében az AVI és a MOV fájlok közötti különbségek a használt kodekek függvényében keletkeznek.
A tárolófájl azt határozza meg, hogy a benne lévő adatfolyamok hogyan szerveződnek. Az adatfolyamok tényleges szervezését és ábrázolását a különböző típusú kodekek végzik. A codecek hatással vannak a videó minőségére és a tömörítésre. Leírja, hogyan kell tömöríteni és kicsomagolni a video- vagy audioadatokat. Ezért egy MOV-fájl és egy AVI-fájl csak azon a alapon fog eltérni, hogy melyik kodeket használják. Valójában majdnem pontosan ugyanazok lesznek, ha mindkét fájltípusban ugyanazt a kodeket használjuk.
Lényegében a kettő között a fő különbség az, hogy egy MOV fájlt először csak az Apple számítógépek használtak, de később később Windows PC-n futhatott. Hasonlóképpen az AVI egy MOV-fájl Windows-kiadása volt. Ezek a konténerfájlok, valamint mások is csaknem minden típusú számítógépen futhatnak.
A .mov fájl lényegében egy QuickTime fájl. Az Apple Computer 1991-ben vezette be. Ez volt az első igazi sikeres multimédiás formátum. A QuickTime egészen előrehaladott volt. Támogatott bármilyen mennyiségű folyamot és több szegmensű fájlt. Lehetővé tette a felhasználó számára, hogy videókat nézhessen a számítógépen, ami meglehetősen új koncepció volt.
A Microsoft visszautasította a .avi fájlt a következő évben. Az AVI az Audio Video Interleave. A Video for Windows technológia része volt. Az MOV-hoz hasonlóan hang- és videóadatokat is tartalmazott egy fájltartályban, amely lehetővé tette a szinkron audio-video lejátszást. Abban az időben azonban az AVI nem rendelkezett a QuickTime kifinomultságával és a fejlett funkciókkal. Később a Microsoft megnyitotta az OpenDML csoport formátumát annak fejlesztéséhez. Végül a Microsoft csökkentette az AVI formátumot a WMV formátumuk javára. Az AVI viszont a kalóz filmek választási formájává vált, valószínűleg a program egyszerűsége miatt.
Lényegében az AVI és a MOV fájlok közötti különbségek a használt kodekek függvényében keletkeznek. Az AVI általában nagyobb, mint a legtöbb videó formátum. Ez főként a rendelkezésre álló minimális tömörítési jellemzőknek köszönhető. Másrészt az MOV-nak több tömörítési lehetősége van a különböző kodekek használatára, ezért gyakran kisebb méretű.
Továbbá, a codec-ektől függően, egy AVI-fájl támogathat több video- vagy audiofolyamot. A MOV-fájlok is képesek erre, és képesek lesznek a feliratok átfedésére a fő videofolyamban.
Jelenleg az AVI a legnépszerűbb és leggyakrabban használt fájlformátum. Ezt számos videó lejátszó, valamint néhány mobil eszköz támogatja. A MOV-t azonban továbbra is főleg a Mac felhasználók használják. Általában nem használják olyan gyakran, mint az AVI-t az Apple-felhasználóknál.