Főbb különbség: A két sejt közötti fő különbség az, hogy a prokarióta sejtek alapvetően nem rendelkeznek nukleáris sejtekkel, míg az eukarióta sejtek igazi magjaik. Az eukarióta sejtek nagyobbak és összetettebbek, mint a prokarióta sejtek.

Minden élő szervezetet két csoportba sorolhatunk a sejtek alapvető szerkezetétől függően. A sejtek két fő osztálya a prokarióták és az eukarióták. Ezek a két sejttípus nagyon sok közös. Ugyanezeket a funkciókat látják el, és ugyanúgy. Mindkettőt plazma membránok zárják be, amelyek tele vannak citoplazmával, és kis szerkezetűek, amelyeket riboszómának neveznek. Mindkettő rendelkezik DNS-sel, amely az archivált utasításokat tartalmazza a cella működéséhez. Van azonban néhány különbség a két típusú sejt között.

A prokarióta kifejezés a görög „prokarióta” szóból származik, ami a magok előtt áll. A prokarióták olyan sejtekből épülnek fel, amelyeknek nincs sejtmagja vagy bármilyen membránnal bevont organellája. Ez azt jelenti, hogy nincsenek maguk. A prokariótákban lévő genetikai anyag, azaz a DNS, nem kötődik a maghoz. Emellett a DNS kevésbé strukturált és egyetlen hurokban van. A legtöbb prokarióta csak egyetlen sejtből áll, és egysejtű szervezetnek nevezik. Van néhány prokarióta is, amelyek sejtek gyűjteményéből készülnek, és többsejtű szervezeteknek hívják őket. A prokarióták két csoportra oszlanak:

• baktériumok
• archaea

Az eukarióták olyan sejtekből épülnek fel, amelyek membránhoz kötött magot és membránhoz kötött szerveket tartalmaznak. Az eukarióta kifejezés a görög „œeukaryoteâ” szóból származik, ami igaz vagy jó magokat jelent. Ez a cella tartalmazza az összes életvilágot, kivéve a monerát. Ezek a szervezetek megtartják a sejtekben a genetikai anyagot. Az eukariótákban található genetikai anyag egy sejtmagban található. Ezeknek a szervezeteknek a DNS-je strukturált és kromoszómákba rendeződik. A DNS lineáris, és fehérjékhez kapcsolódik, hogy kromatint képezzen. Az eukarióta szervezetek lehetnek többsejtű vagy egysejtű szervezetek. Minden állatot eukariótának tekintünk. Más eukarióták közé tartoznak a növények, gombák és protisták.

A prokarióta és az eukarióta sejtek mind nagyságrendben, mind összetettségükben egymáshoz kapcsolódnak. Ezek a sejtek különböznek egymástól. Mindazonáltal egyértelműen hasonlóak, mint a különbözőek, és egyértelműen evolúciós kapcsolatban állnak egymással. A biológusok úgy vélik, hogy az eukarióta sejt egyértelműen fejlődik a prokarióta sejtből.

A prokarióta és az eukarióta sejt összehasonlítása:

	Prokarióta sejt	Eukarióta sejt
Meghatározás	Ezek olyan sejtekből álló szervezetek, amelyeknek nincs sejtmagja vagy bármilyen membránnal bevont organellája.	Ezeket a szervezeteket olyan sejtek alkotják, amelyek membránhoz kötött magot és membránhoz kötött szerveket tartalmaznak.
Atommag	Nincs magja.	Valódi magja van, amelyet egy kettős membrán határol.
DNS-elrendezés	Kör alakú hurokkal rendelkezik.	Ez lineáris.
Méret	Kis cellák (<5 µm)	Nagy sejtek (<10 µm)
Sejt	Mindig egysejtű	Többnyire többsejtű
Sejtfal	Általában jelen van; kémiailag összetett jellegű	Ha jelen van, kémiailag egyszerű
Fehérje	Nem tartalmaz fehérjét a DNS-ben.	Fehérjéket tartalmaz a DNS-ben, hogy kromatint képezzen.
A riboszóma	Kis riboszómákat tartalmaz.	Nagy riboszómákat tartalmaz.
Citoplazma	Nincs citoszkeleton	Mindig legyen citoszkeleton
Sejtosztódás, mitózis	A sejtosztódás bináris hasadással történik	A sejtosztódás mitózis
Reprodukció	A sokszorosítás mindig asszexuális	A reprodukció asszexuális vagy szexuális
Metabolikus útvonalak	Az anyagcsere-útvonalak sokfélesége	Gyakori metabolikus útvonalak
csilló	Két fehérje építőelemből áll	Komplex jellegű és több mikrotubulusból áll
Több cellás formák	Ritka	Gyakori a kiterjedt szövetképződéssel
Mesosomes	A golgi-testek és a mitokondriumok funkcióit végzik, és segítenek a kromoszómák elválasztásában is.	Nincs jelen
Plazma membrán	Nincs szénhidrát és nincs sterol	A szterolok és a szénhidrátok egyaránt jelen vannak
glikokalix	Kapszula vagy szálréteg	Vannak olyan sejtek, amelyekben nincs sejtfal
Példa	Baktériumok és Archaea	Állati sejtek és növényi sejtek