Főbb különbség: A FAT32 és az NTFS a merevlemezek partícionálásához és formázásához használt fájlrendszerek és lemez szabványok. Összehasonlítva, a FAT32 egy régebbi és egyszerűbb verziója az NTFS-nek, amely új, és egy jól ismert változatú fájlrendszer.

A FAT32 a Windows 95 OSR 2 és Windows 98 operációs rendszerekben elérhető fájlelosztási táblázat változata. Ez egy gyakori fájlrendszer, amelyet a legtöbb számítógépen használnak. A fájlrendszert a 32 bites tároló táblázatot használta fel. Alapfunkciója a lemezek címeinek rögzítése a partíció során. A fájlrendszer legfeljebb 24 partíciót tartalmazhat, amelyek 32MB és 137GB között mozoghatnak. Ezek a partíciók a Windows 9x operációs rendszer alatt működnek, és felelősek a merevlemezen lévő hely elérhetőségéért. A Windows 9x operációs rendszer korlátai vannak, amelyeket figyelembe kell venni a partíciók elérhetővé tétele közben. A fennmaradó operációs rendszerek a FAT32 fájlrendszert a megfelelőségük és képességeik szerint használják. A FAT32 fájlrendszert tipikusan a Windows 9x számítógépen tárolt fájlrendszerként használják olyan partíción, amely nem haladja meg a 126 GB-ot.

A FAT32 a következő fejlesztéseket nyújtja a régebbi FAT-verziókhoz képest:

• A FAT32 legfeljebb 2 terabájtos meghajtót támogat.
• A FAT32 hatékonyabban használ helyet.
• A FAT32 kisebb klasztereket használ (azaz 4-KB-os klaszterek 8 GB-ig terjedő meghajtókhoz), így a lemezterület 10-15% -kal hatékonyabb a nagy FAT vagy FAT16 meghajtókhoz képest.
• A FAT32 erősebb, mint a régebbi FAT verziók.
• A FAT32 rugalmasabb; gyökérmappája egy szokásos klaszterláncot vezet, amely lehetővé teszi a fájlrendszer elérhetőségét a meghajtó bármely sarkában.

Az NTFS egy fejlett és gazdag fájlrendszer. Az NTFS rövidítése az New Technology File System (Új technológiai fájlrendszer). Ez a fájlrendszer a legfejlettebb és legújabb fájlrendszer; magasan fejlett írási technikával, jobb biztonsággal és nagy kapacitású helykihasználással rendelkezik. A formázáskor a merevlemez partíciókra vagy nagyobb részekre oszlik. Az operációs rendszer minden partíción belül nyomon követi az adott operációs rendszer (operációs rendszer) által tárolt összes fájlt. Ezért minden fájl egy merevlemezen van tárolva egy vagy több fürt vagy csoport formátumban, ami 512 bájtról 64 bájtra terjed. A fájlokat speciális fájlformátumba rögzíti az NTFS-ben. Ezek a fájlformátumok Master File Table (MFT) néven ismertek. Ezeket a rekordokat tovább használják a fájlok megkereséséhez, ha a csoportok között vannak szétszórva. Az NTFS megpróbálja megtalálni azt a tárolóterületet is, amely a teljes fájlt tárolja a fürtökkel együtt.

Az NFTS néhány legfontosabb jellemzője:

• Az NTFS b-tree könyvtárrendszert használ a fájlcsoportok nyomon követésére.
• Az NTFS tárolja a fájlcsoportok és más adatok adatait.
• Az NTFS támogatja a nagyméretű fájlokat (legfeljebb 2 a 64-es vagy körülbelül 16 milliárd bájt méretű).
• Az NTFS egy Access Control List (ACL), amely lehetővé teszi a kiszolgáló adminisztrátorának, hogy ellenőrizze a felhasználót, aki hozzáfér az adott fájlhoz.
• Az NTFS rendelkezik az integrált fájltömörítési rendszerrel.
• Az NTFS támogatja az Unicode-ot, amely névrendszereken alapul.
• Az NTFS a hosszabb fájlnevekkel együtt támogatja a "8 3" nevet is.
• Ez biztosítja az adatbiztonságot mind a cserélhető, mind a rögzített lemezeken.

Összehasonlítás a FAT32 és az NTFS között:

	FAT32	NTFS
Betűszó	Fájlkiosztás 32. táblázat	Új technológiai fájlrendszer.
Bemutatott	1977-ben vezették be.	1993-ban vezették be.
Ők	A FAT32 szabványos rendszer, mivel támogatja a Windows több verzióját.	Az NTFS-t a Windows újabb verziói támogatják, mint például a Windows XP, a Windows 2000 és újabb.
változatok	A FAT32 a régebbi Microsoft fájlrendszer.	Az NTFS a Windows által használt jelenlegi fájlrendszer.
Fájl méret	Maximális fájlméret 4 GB.	A fájl mérete korlátozza a kötet méretét.
Az operációs rendszer támogatása és követelménye	Nem támogatja a Windows 2000 vagy a Windows 2003 Active Directory használatát.	Ehhez Windows 2000 vagy Windows 2003 Active Directory vagy megosztott fürtmeghajtók használata szükséges.
Hozzáférés	Nem engedélyezi a merevlemezen lévő fájlokhoz való hozzáférést az MS-DOS segítségével.	Nem engedélyezi a merevlemezen lévő fájlokhoz való hozzáférést az MS-DOS segítségével.
Helyreállítási képesség	Nem képes automatikusan helyreállítani néhány lemezzel kapcsolatos hibát.	Lehetősége van arra, hogy automatikusan helyreállítson néhány lemezzel kapcsolatos hibát.
Fájlfeldolgozási sebesség	Ez lassú a fájlátviteli folyamatban.	Gyorsabb a fájlátviteli folyamatban.
Fájltömörítési módszer	A FAT32 nem támogatja a fájl tömörítését.	Az NTFS támogatja a fájltömörítést.
konverziók	A FAT32 átalakítható NTFS-re.	Nehéz átalakítani az NTFS-et FAT32-re.